Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pop7Q9DCH2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pop7Q9DCH2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms