Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syde1Q9DBZ9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syde1Q9DBZ9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms