Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms