Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcg8Q9DBM0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Abcg8Q9DBM0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms