Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pop5Q9DB28 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pop5Q9DB28 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pop5Q9DB28 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pop5Q9DB28 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pop5Q9DB28 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pop5Q9DB28 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pop5Q9DB28 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pop5Q9DB28 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pop5Q9DB28 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pop5Q9DB28 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pop5Q9DB28 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Pop5Q9DB28 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pop5Q9DB28 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pop5Q9DB28 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pop5Q9DB28 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pop5Q9DB28 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms