Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrmuQ9DAT5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms