Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9DA42 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9DA42 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9DA42 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9DA42 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9DA42 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9DA42 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9DA42 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9DA42 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9DA42 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9DA42 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9DA42 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9DA42 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9DA42 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9DA42 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9DA42 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9DA42 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9DA42 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9DA42 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9DA42 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9DA42 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9DA42 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9DA42 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9DA42 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9DA42 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9DA42 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9DA42 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9DA42 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms