Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smco2Q9DA21 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smco2Q9DA21 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms