Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Subh2bvQ9D9Z7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Subh2bvQ9D9Z7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms