Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D9H8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D9H8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D9H8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D9H8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms