Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tmco5aQ9D9D5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tmco5aQ9D9D5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Tmco5aQ9D9D5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Tmco5aQ9D9D5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Tmco5aQ9D9D5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Tmco5aQ9D9D5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmco5aQ9D9D5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Tmco5aQ9D9D5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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