Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot8Q9D8X5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms