Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rexo2Q9D8S4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rexo2Q9D8S4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms