Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc91Q9D8L5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms