Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fip1l1Q9D824 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms