Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7X1

Kctd4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd4Q9D7X1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kctd4Q9D7X1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms