Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gbe1Q9D6Y9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gbe1Q9D6Y9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms