Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc52a3Q9D6X5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc52a3Q9D6X5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms