Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec23bQ9D662 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23bQ9D662 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms