Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt34Q9D646 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt34Q9D646 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms