Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PudpQ9D5U5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms