Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Speer4f1Q9D5Q6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms