Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms