Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efhd1Q9D4J1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Efhd1Q9D4J1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms