Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gcc1Q9D4H2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms