Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pabpc6Q9D4E6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms