Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lrp2bpQ9D4C6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms