Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhc2Q9D485 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhc2Q9D485 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhc2Q9D485 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhc2Q9D485 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhc2Q9D485 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhc2Q9D485 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhc2Q9D485 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efhc2Q9D485 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms