Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rsph14Q9D3W1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rsph14Q9D3W1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms