Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rufy3Q9D394 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms