Protein–RNA interactions for Protein: Q9D328

Tmem35a, Transmembrane protein 35A, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35aQ9D328 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Tmem35aQ9D328 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Tmem35aQ9D328 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tmem35aQ9D328 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tmem35aQ9D328 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tmem35aQ9D328 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tmem35aQ9D328 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Tmem35aQ9D328 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tmem35aQ9D328 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tmem35aQ9D328 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Tmem35aQ9D328 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Tmem35aQ9D328 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem35aQ9D328 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms