Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vsig1Q9D2J4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms