Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pramef12Q9D2F1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pramef12Q9D2F1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms