Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Spns3Q9D232 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Spns3Q9D232 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms