Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Syf2Q9D198 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms