Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ss18l2Q9D174 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms