Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem53Q9D0Z3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms