Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpsap1Q9D0M1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms