Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NkapQ9D0F4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NkapQ9D0F4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NkapQ9D0F4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NkapQ9D0F4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NkapQ9D0F4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NkapQ9D0F4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NkapQ9D0F4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NkapQ9D0F4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NkapQ9D0F4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NkapQ9D0F4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NkapQ9D0F4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NkapQ9D0F4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms