Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gtf2e1Q9D0D5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms