Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spc24Q9D083 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spc24Q9D083 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms