Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc47Q9D024 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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