Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Polr3eQ9CZT4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Polr3eQ9CZT4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms