Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc77Q9CZH8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms