Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Mrpl55Q9CZ83 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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