Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssu72Q9CY97 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssu72Q9CY97 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms