Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Yif1bQ9CX30 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms