Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Utp23Q9CX11 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Utp23Q9CX11 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Utp23Q9CX11 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms