Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prkrip1Q9CWV6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prkrip1Q9CWV6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms