Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CWU4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CWU4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CWU4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CWU4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CWU4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CWU4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CWU4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CWU4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms